通常盆栽植物的营养土不需特别消毒杀菌，只需就可以了阳光曝晒就可以了。这是由于，一方面盆栽花卉自身有着一定的抵抗能力；另一方面，土质中富含很多的细小微生物，它们的活動陆陆续续分解出很多营养成分，以维持土壤肥力，有益于花卉植物生長。也可以用高温消毒，或药剂消毒杀菌，但细小微生物被杀掉，土质中的有机物物质不能分解，不益于花卉植物消化吸收。用以插枝和种植的营养土要严格消毒杀菌，这是因为病菌很容易从插穗创口进入花卉植物里面，致使腐坏，影响到成活，对种植而言，刚长出的芽，抵抗能力比较弱，细小微生物常致使它起霉。

　　经常使用的土壤消毒法：蒸煮消毒杀菌法是把已调好的营养土放进适当的器皿中，蒸煮消毒杀菌30分钟左右就可以了。药剂消毒杀菌法主要是用福尔马林消毒杀菌。每升营养土中均匀的撒上40%的福尔马林溶液4mL至5mL，随后封口，避免其漏气现象。置放2天后打开。